Next generation sequencing, NGS

  • 加快定序速度
  • NGS跟一般定序不同的地方:
    • 沒有cloning bias的爭議
    • 轉接序列的連結
    • 讀取的序列較短
    • 產量高
  • 適用於對已知序列的基因組進行重新定序
  • 應用:
    • 全基因合成
    • 全基因體定序
    • Transcriptome合成與分析:分析mRNA、miRNA表現量分析
    • 突變基因分析
    • 基因體中基因甲基化分析

Transcriptome sequencing

  • 轉錄特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA的總和。
  • 基因表現量分析、基因功能及結構研究
  • 應用:
    • 疾病的預測及治療(例如:癌症)
    • 毒理學
    • 發現Noncoding RNAs
    • alternative splice sites分析
Design experiment
RNA extract
sample preparaction
NGS
Data analysis

Exome capture sequencing

Resequencing