Nucleic acid

SNP/ Seuquence variant analysis

DNA extract

Assay design and optimization

Capillary Electrophoresis

Data analysis

Sequence variant detection

• 主要利用定序的原理：
  • 尋找突變基因
  • 預測基因體中多型性差異
• 應用：
  • 預測不同個體對疾病感受性的差異
  • 評估個人化治療的方向

DNA extract

Assay design and optimization

PCR amplification

sequencing --> confirm variant

SBE SNP detection

• SBE SNP為Single base extension Single-nucleotide polymorphism
• 基因型別的鑑定，SNP genotypes的方法之一
• 適用於已知的SNP位置上，偵測並區分單一核苷酸的差異。
• 可得知確切的單一核苷酸訊息，並非只得到其基因型為 heterozygous或homozygous的資訊。
• SNaPshot® Multiplex System

DNA extract

Assay design and optimization

SNaPshot Multiplex Kit reaction

genescan analysis

TaqMan SNP Genotyping assay

SNP 偵測的方式有數種，包括直接定序、片段分析以及TaqMan Assay。利用TaqMan assay 來進行偵測，適用於大量待測樣品針對已知之SNP位點進行偵測，目前已有超過450 萬個人類與小鼠預先設計好的assay可供採用。我們可以在一次反應中進行384 個樣品的偵測，準備好您的樣品，告訴我們您想要研究的位點，我們提供您分析結果，如有需求還可以進行進一步的定序確認。

• 利用TaqMan® 5’-nuclease assay chemistry 的原理
• 提供快速且簡單的方法得到SNP genotyping 的結果

DNA extract

TaqMan SNP Genotyping Assay

sample detect

Data analysis

Data analysis

Sequence variant detection

• 主要利用定序的原理：
  • 尋找突變基因
  • 預測基因體中多型性差異
• 應用：
  • 預測不同個體對疾病感受性的差異
  • 評估個人化治療的方向

DNA extract

Assay design and optimization

PCR amplification

sequencing --> confirm variant

DNA Sequencing Service

• 核酸序列分析
• 本公司使用最先進之定序系統ABI 3730
• 定序結果HiQV 值可達1000bps 以上
• 公司免費提供多種定序常用引子：
  • M13 Forward & Reverse、T3、T7、T7-terminator、SP6、pGEX3’/5’、α-factor、polyhedrin、S-Tag、BGH- Reverse、RVprimer 3、GLprimer 2 等。
• 專業優化團隊並提供一貫化服務並提供您定序之專業問題諮詢。

colony/culture 之plasmid DNA 序列分析

sample preparation

sequencing reaction

read sequence

Data analysis

Walking 定序

• 較長的核酸序列定序
  • 整個plasmid 或插入plasmid 大片段定序
• 從一段已知序列做為primer 開始定序，得到新的已知序列即可設計新的primer，重複此方法直到未知序列定序完成。

SSR/STR analysis

• 用於建立物種/品種資料庫
• 用於建立特定物種篩選平台
• 品種鑑別；分子育種

DNA extract

PCR amplification and verification

Capillary Electrophoresis

Data analysis

SSR/STR marker development

DNA extract

NGS

Assay design and optimization

sequencing

confirm SSR/STR sequencing

Capillary Electrophoresis

Data analysis

Specific gene expression assay design and optimization

genetic database collect and identify

primers and probes design

qPCR Assay Optimization

Dverify efficiency and specificity

Taqman® gene expression assay

• 如果您所研究的生物為Human、Mouse、Rat，大部 分的基因都已經有assay 可以直接購買使用。
• 針對特定的基因可以迅速的得到偵測的結果
• 告訴我們您想研究的基因，並提供待測樣品，我們可以協助您挑 選適合的assay，並完成實驗，提供您基因表現量的分析結果。

RNA extract & cDNA synthesis

Taqman® gene expression assay

Sample detect

Data analysis

Taqman pathway array & SA bioscience array

提供我們您想研究的pathway，並提供待測樣品，我們可以協助您挑選適合的array，並完成實驗，提供您基因表現量的分析結果。

• 細胞內的基因表現由幾百種訊號傳遞路徑(singnling pathways)精確地協調合作調控，這些訊號傳遞路徑(singnling pathways)是經由轉錄因子、染色質的蛋白質、以及影響表觀遺傳(epigenomics)因子精確地調控。
• 應用：
  • 研究分子層次的細胞的生化反應過程
  • 了解基因特定的生化反應過程、調控路徑、疾病狀 態相關資訊
  • 選擇有興趣的路徑進行研究
• 我們提供的平台包括：
  • 96Well TaqMan® Gene Expression Assays
  • TaqMan® Gene Expression Assays：384well TaqMan® Gene Expression Assays，384-Well Microfluidic Card TaqMan® Gene Expression Assays
  • RT² Profiler PCR Array：96Well RT² Profiler PCR Array，384well RT² Profiler PCR Array

常見的偵測標的如下表：(持續增加中)

RNA extract& cDNA synthesis

SA bioscience array/TaqMan pathway array

sample detect

Data analysis

Methylation detection

• 影響基因表現使遺傳型態不同，但不改變DNA序列。
• 利用EpiTect Methyl II PCR Array進行偵測，實驗過程與Taqman pathway array及SA bioscience array一致，可委託我們進行實驗亦可訂購Array。
• 應用：
  • 疾病感受性檢測
  • 癌症相關研究

Cloning

• TA cloning and DNA Fragment cloning
• 選殖是針對特定DNA位置或基因分析，在分子生物研 究上，是一個很重要的工具，用運選殖 技術可將有興趣的標的基因，接入載體後，即可對特定DNA位置或基因做進一步研究，而選殖可因為起始樣本不同，可分成TA cloning與DNA Fragment cloning兩種選殖方法，分別針對PCR產與DNA片段來進行。